单位内设13个机构，其中管理机构6个，业务机构7个。
一、管理机构
（一）办公室
承担行政管理、日常政务运作、上传下达、文书处理、协调督办、新闻宣传、机要、保密、信访、档案、重大政策研究、重要文件起草等工作；负责震防中心后勤服务管理和香山基地管理，负责基本建设和修购项目实施。
办公电话：010-69941024
（二）业务管理处
负责事业发展规划编制，以及业务部门统筹管理和协调服务，协调管理地震灾害风险防治、地震应急、公共服务、政策法规、震灾预防标准化和科技外事等工作，负责科技委日常工作；牵头地震灾害风险防治公共服务和能力建设、信息化建设等重点项目和重大工程的组织、协调与管理，承担新时代防震减灾事业现代化建设领导小组办公室日常工作。
办公电话：010-69941089
（三）财务资产处
负责预算、决算、财务、审计、基本建设、政府采购、综合统计和国有资产管理等工作，负责财务室运行，负责经营性实体的财务管理。
办公电话：010-69941050
（四）人力资源处（离退休干部办公室）
负责干部队伍建设、人才队伍建设、人事管理、机构编制、教育培训、工资福利和干部监督工作；负责离退休干部管理和服务工作。
办公电话：010-69941033
（五）党委办公室
负责党建、统战、群团等工作。
办公电话：010-69941062
（六）纪检室
负责纪检工作。
办公电话：010-69941038
二、业务机构
（一）地震区划与抗震设防部
牵头全国地震动参数区划、全国地震灾害风险区划、重大工程地震安全性评价和区域性地震安全性评价业务指导工作，承担地震区划与地震安全性评价技术方法研究、标准制定、应用工具研发与科技服务工作，承担全国地震区划和地震安全性评价数据中心及土动力学实验室的建设、运维与服务工作；建立全国地震区划基础数据和业务支撑平台，牵头组织相关技术研发与成果应用，承担全国地震区划日常业务指导与服务。
办公电话：010-69941159
（二）活动构造探察部
承担活动断层探测与地震危险性评价、地震地质灾害调查与评价、潜在震源区划分等技术研发工作；承担活动断层探测与地震危险性评价、地震地质灾害调查与评价、区域地震构造评价、重大工程场地地震地质问题评价等工作；承担活动断层鉴定中心建设、运维与服务工作。
办公电话：010-69941151
（三）震灾风险评估部（地震灾害风险与保险重点实验室）
负责牵头全国地震灾害风险评估，承担地震灾害破坏性调查，承担年度地震危险区灾害损失预评估和地震灾害损失评估工作，承担地震保险基础相关理论研发与应用技术研究、标准制定、应用工具研发，承担承灾体调查和地震灾害风险评估技术服务；承担地震灾害风险与保险重点实验室建设、运维与服务，承担地震灾害损失预评估与现场评估相关技术研发和数据管理。
办公电话：010-69941078
（四）公共服务部
承担地震灾害风险防治公共服务规划设计、数据资源汇集、效能评估，构建数据共享服务体系；负责震灾预防标准化技术委员会秘书处日常工作，承担地震灾害风险防治公共服务政策法规、标准化和技术规范研究，参与抗震防灾规划、应急避难场所规划、恢复重建规划编制工作；承担《震灾防御技术》《防灾博览》的编辑与发行工作，承担资料档案管理。
办公电话：010-69941182
（五）成果推广应用部
承担地震灾害风险防治技术咨询与服务工作，负责科技成果转化项目的市场运营和项目实施全过程管理；负责北京震鼎工程勘察院监管。
办公电话：010-69941060
（六）地震灾害风险数据中心（地震活动断层数据中心）
牵头编制地震灾害风险防治信息化规划与标准体系建设，牵头开展全国地震灾害风险防治信息化建设，负责全国地震灾害风险防治管理信息系统的设计、建设与运维；负责全国地震灾害风险数据的汇交、检测、存储、质量监控、加工与信息共享，承担地震灾害风险防治信息化的新技术应用和技术协调管理；承担全国地震活动断层数据中心日常工作；负责震防中心信息化基础设施建设与运维。
办公电话：010-69941178
（七）国（境）外地震灾情评估部
负责国（境）外地震灾害评估业务系统建设和运维；承担国（境）外地震灾害数据库建设、灾情信息自动收集，开展快速评估等新技术新方法研究；负责《每周国（境）外地震灾情》编报；负责产出国（境）外地震灾情评估报告。
办公电话：010-69941269
